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随着分子生物学的研究进展,人们逐渐理解基因突变对结直肠癌(CRC)患者临床获益的影响。西方研究表明,KRAS突变(外显子2)和KRAS/NRAS突变(外显子2、3、4)被认为是抗EGFR单克隆抗体治疗的阴性预测因子。在新发布的日本肿瘤内科学会(JSMO)(第三版)中,除了RAS突变,BRAF V600E突变和DNA错配修复(MMR)缺陷,也成为影响预后及***佳治疗方案选择的重要依据。检测技术也得到快速发展,以新一代测序(NGS)技术为基础的综合基因检测分析和体细胞基因检测的循环肿瘤DNA(ctDNA)(液体活检)分析为主。
随着分子生物学的研究进展,人们逐渐理解基因突变对结直肠癌(CRC)患者临床获益的影响。西方研究表明,KRAS突变(外显子2)和KRAS/NRAS突变(外显子2、3、4)被认为是抗EGFR单克隆抗体治疗的阴性预测因子。在新发布的日本肿瘤内科学会(JSMO)(第三版)中,除了RAS突变,BRAF V600E突变和DNA错配修复(MMR)缺陷,也成为影响预后及***佳治疗方案选择的重要依据。检测技术也得到快速发展,以新一代测序(NGS)技术为基础的综合基因检测分析和体细胞基因检测的循环肿瘤DNA(ctDNA)(液体活检)分析为主。
结直肠癌分子检测的基本要求
1.对不可切除晚期或复发性CRC患者进行抗EGFR单克隆抗体治疗之前,推荐进行RAS(KRAS/NRAS)突变检测(强烈推荐)。
几个随机临床研究表明,抗EGFR单克隆抗体治疗不能使KRAS外显子2、3、4和NRAS外显子2、3、4突变患者获益。这也在大规模META分析中得到证实,不论抗EGFR单克隆抗体类型(西妥昔单抗或帕尼单抗)、联合化疗和化疗类型如何,都发现这种趋势的可重复性。
2.推荐经认证的有效方法如体外诊断对肿瘤组织样本进行RAS突变检测(强烈推荐)。
检测RAS突变的方法包括:(i)PCR为基础的特异性检测技术,如等位基因特异性PCR和PCR-rSSO;(ii)扩增靶基因再直接测序
3.晚期或复发性CRC患者一线治疗之前,推荐进行BRAF V600E突变检测(推荐)。
BRAF V600E突变是CRC患者预后不良的独立预测指标。***近有研究报道,三联化疗(FOLFOXIRI)氟尿嘧啶(5-FU)+奥沙利铂+伊立替康联合贝伐珠单抗对不可切除晚期或复发性BRAF V600E突变的CRC患者更有效。欧洲医学肿瘤学协会(ESMO)共识指南也推荐三联化疗+贝伐珠单抗是BRAF V600E突变患者的***佳选择。
4.对肿瘤组织样本直接进行测序(结合手工显微解剖)或使用PCR为基础的方法检测BRAF V600E突变(推荐)。
在以往的研究中,直接测序的突变检出限为10%-25%。其他方法的突变检出限为1% - 10%。考虑到这些不同的检测方法对该预后不良指标显示一致性结果,建议检测BRAF V600E突变的检出限为1%~10%。
5.对疑似Lynch综合征的CRC患者的肿瘤组织样本进行DNA错配修复(MMR)缺陷检测(强烈推荐)。
Lynch综合征是由MLH1、MSH2、MSH6和PMS2的胚系系突变引起的常染色体显性遗传性疾病。虽然这是一种罕见性疾病,西方国家占2%-4%,日本CRC患者占0.7%,但Lynch综合征在临床上具有重要意义,因为患者和他们的家庭成员患恶性肿瘤的风险增加。因此,强烈推荐疑似患有Lynch综合征的CRC患者进行MMR缺陷检测。
6.微卫星不稳定检测和MMR蛋白免疫组化检测推荐用于肿瘤MMR缺陷检测(强烈推荐)。
通过评估不同长度微随体(由微卫星区异常重复引起)是否存在(MSI检测)或测定MMR蛋白是否缺失(IHC)确定肿瘤中MMR蛋白功能。高水平或高频率MSI(MSI-H)或MMR蛋白缺失认为是MMR缺陷(dMMR),而低频率MSI(MSI-L)、微卫星稳定(MSS)或MMR蛋白表达阳性被认为是功能完善的MMR(pMMR)。
7.对于进行过根治性切除术的II期结直肠癌患者,推荐对其肿瘤组织样本进行MMR缺陷检测(推荐)。
基于比较单纯手术与术后5-FU治疗的III期META分析,目前认为dMMR是II期/III期结肠癌患者复发风险低的预测因素,尤其是II期结直肠癌患者。许多研究表明,术后5-FU单药治疗疗效低,或增加复发风险,或使生存期降低。因此,推荐MMR缺陷检测来预测根治性切除术II期结直肠癌患者的复发风险和预后。
8.在不可切除晚期或复发性CRC患者进行一线治疗之前,对其肿瘤组织样本进行MMR缺陷检测(专家共识意见)。
有研究显示,在野生型BRAF V600E患者中,与pMMR患者相比,dMMR不可切除晚期或复发性CRC患者具有较差的生存率。因此,当开始一线治疗时,MMR缺陷检测联合BRAF V600E突变检测可以用来预测预后。抗PD-1抗体在dMMR不可切除晚期或复发性CRC患者中显示出较好的疗效,FDA于2017年批准pembrolizumab和nivolumab用于这些患者。
9.推荐体细胞基因检测使用***固定、石蜡包埋组织块;确认未染色、薄切片含有足够数量的肿瘤细胞,并采用配对HE染色(强烈推荐)。
10.应在质量保证体系下进行CRC基因检测(强烈推荐)。
实施各基因检测的时间和种类
体外诊断往往和核酸提取与纯化紧密相关,吉恩特公司生产的磁珠法核酸提取试剂盒,能够高通量自动化地进行核酸提取与纯化。为体外诊断和癌症诊疗相关研究打下良好基础。