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非洲南部和东部草原上的平原斑马（Equus quagga）的六个亚种的分类一直以来依据其头部形状和条纹图案。然而，本周《自然 - 生态与进化》在线发表的一篇新研究 A southern African origin and cryptic structure in the highly mobile plains zebra 揭示这些亚种之间的遗传差异与该形态分类并不吻合。
斑马遭受栖息地丧失和狩猎的威胁。环境保护机构目前用形态分类法评估斑马的亚种种群数量，但是 Casper-Emil Pedersen 和同事提出应该根据他们的遗传新发现改进这种分类。
作者对 59 匹平原斑马、3 匹山斑马和 3 匹细纹斑马开展了全基因组分析。根据地理位置和遗传差异，他们鉴定 9 个现存的平原斑马种群，其中只有两个和当前根据形态学分类的亚种重合。作者的模型表明今天多种斑马群落的祖先很有可能生活在非洲南部的赞比西河奥卡万戈湿地地区。他们的分析也证实了已经灭绝的斑驴（Equus quagga quagga）是平原斑马的一个变种，而非一个独立物种。
不同平原斑马种群的取样地。
基于他们的发现，作者总结，确保不同斑马种群之间的基因流动对物种生存至关重要，而***有效的手段是通过保护措施连接斑马栖息地，而非使其彼此分离。
遗传亲缘关系观察需要大量的基因测序，不可避免要进行大规模核酸提取与纯化， 非常适用于自动和核酸提取。
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