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数据驱动的生物标志物发现为改善接触过敏的诊断铺平了道路

作者: 发布时间:2020-12-18 浏览次数:668
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借助算法,瑞典Karolinska研究所的研究人员确定了可以区分刺激性湿疹和接触性过敏的标记物,这两种皮肤反应看似相似,但需要不同的治疗方法。他们的发现发表在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上,支持进一步开发替代今天的诊断斑贴试验。

高收入国家约有20%的人口受到接触性湿疹的影响,湿疹是一种经常与工作环境中的化学品接触相关的疾病。接触性湿疹有两种类型,每种都有其自身的原因:过敏性接触性湿疹,是由过敏反应引起的。以及由化学制剂或物理因素引起的非过敏性刺激性湿疹。

由于两种类型需要不同的治疗方法,因此必须做出正确的诊断,这一点很重要。对于皮肤科医生来说,这很困难,因为这些疾病表现出相似的临床症状。诊断通常基于补丁测试的结果,通常难以解释,有时会给出假阳性或假阴性结果。

在本研究中,研究人员在卡罗林斯卡医学院和芬兰和奥地利的大学同事比较了85例性接触性湿疹和健康的皮肤样本斑贴试验,以检查基因表达在皮肤暴露于不同的过敏原和刺激所致。

使用链接到量身定制的遗传算法的机器学习技术,研究人员确定了两个或三个基因集,它们可以共同区分刺激性皮肤过敏反应。结果可以在独立的患者组和外部数据集中复制。外部数据集包括暴露于与***组患者不同物质的患者,这为新的生物标记物奠定了基础。

“我们的结果表明,基于这些生物标志物的新诊断方法的开发潜力很大,”卡罗林斯卡研究所环境医学研究所研究员兼研究组负责人纳娜•菲奎斯特(Nanna Fyhrquist)说。“该项目的下一步需要对标记物进行更广泛的临床验证,并对方法进行技术优化,以达到足够的成本效益和达到临床目的的速度。”

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