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张锋团队有望推动基因组编辑技术的技术创新

作者: 发布时间:2021-09-22 浏览次数:721
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学术期刊《科学》杂志上线了基因编辑领域知名学者张锋教授领衔发表的一篇***新论文。这也是短短一个月时间内,张锋教授团队在基因疗法领域做出潜在颠覆性变革后发表的第二篇《科学》论文。

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这篇论文中,张锋教授团队从CRISPR-Cas系统的起源入手,在细菌中鉴定出一类新的核酸酶,它们由转座子编码的RNA引导到目标位置切割DNA。经过设计,这些核酸酶可以用于在人类细胞中编辑基因。Broad研究所的官方新闻指出,这一发现指向了一个广阔的生物学新领域,有望推动基因组编辑技术的下一次***。

***近十年里,在细菌中发现的CRISPR-Cas系统已经成为了广泛使用的基因编辑工具。例如,通过设计不同的指导RNA,科学家们可以将核酸酶Cas9引导到任何一段想要编辑的DNA序列位置。“改变一段引导序列,就设定了一个新的目标,如此简单。”研究论文的共同***作者、博士研究生Soumya Kannan说,“因此,我们提出了一个宽泛的问题,那就是有没有天然的系统同样使用这种机制。”

线索来自IS200/IS605转座子家族一个子集编码的蛋白IscB。这类蛋白并不参与CRISPR免疫系统,功能未知,过去也不知道它与任何RNA有相互作用。但从结构来推断,IscB可能是小型的DNA切割酶,而且可能是Cas9的祖先。

研究人员使用进化分析、RNA测序和生化实验,从IS200/IS605转座子重建了CRISPR-Cas9系统的进化。结果表明,所有现存的Cas9很可能来自一组IscB。这些IscB蛋白具备核酸酶活性,能够靶向双链DNA进行切割。并且他们发现,每个IscB旁边都有一小段编码产生的RNA(这些RNA被命名为ωRNA),指导IscB切割特定的DNA序列。

在此过程中,研究人员还发现,除了IscB,还有两种转座子编码蛋白IsrB和TnpB同样具有靶向双链DNA 的核酸酶活性,并且由ωRNA引导。进化关系的分析显示,TnpB可能是Cas12的祖先。

由于编码IscB、IsrB和TnpB的基因存在于转座子中,随着转座子的每一次移动,会产生一个新的指导RNA,引导编码的酶在新的目标位点进行切割。

研究人员将这套可编程的DNA修饰系统命名为Obligate Mobile Element Guided Activity,简称OMEGA。值得一提的是,这三种酶的尺寸都很小,只有Cas9的30%左右,因此基于OMEGA开发的基因编辑工具将可以更容易地被送入细胞。

综合来看,此次研究发现的这类核酸酶,在细菌中含量丰富,广泛表达,表明由RNA引导的机制在原核生物中比过去以为的更为丰富。研究人员认为,目前为止人类可能仅仅鉴定出了***常见的一部分,可能还有大量尚未开发的RNA引导机制。

“我们非常兴奋,发现了这些广泛存在的可编程酶,它们一直隐藏在我们的眼皮底下,”张锋教授说, “这些结果表明了一种诱人的可能性,那就是有更多可编程系统可以作为有用的生物技术等待发现和开发。” 

RNA提取磁珠属于纳米生物磁珠的一种,主要作用是用于核酸提取过程中的RNA提取,粒径分布在500nm左右,是洛阳吉恩特生物自主研发生产的高分子纳米磁性微球,该磁珠悬浮时间长,磁响应时间迅速,对DNA甲基化过程中的提取环节提供良好的支持,可明显缩短实验时间,提高实验效率,并在提取结果上保持稳定,配合核酸提取仪,更能实现快速的RNA提取。

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