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这种特殊DNA是时候发挥治疗潜力了

作者: 发布时间:2022-01-25 浏览次数:779
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实际上,脱氧核糖酸分子(DNA)也能通过特定的序列和三维结构促进特定的化学反应。90年代,科学家们通过体外选择方法获得了***批“DNA酶”,用DNA和酶(enzyme)两个词组合起来将其命名为DNAzymes。

DNAzymes作为一种精密的生物催化分子,能够靶向RNA分子进行切割。它们由几十个核苷酸组成,两端的序列经过设计作为“结合臂”,与RNA链上的特定位置相匹配,中间的固定序列则作为“催化核心”切割RNA分子,切割下来的片段在细胞中被迅速降解。

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▲DNAzyme(红色)通过结合臂锚定在RNA链(黄色)的特定位置,然后用其催化核心将RNA切断

正因为可以精确地破坏不需要的RNA分子,DNAzyme的独特功能让人看到了用它来治疗疾病的潜力。比如有些病毒的遗传物质被编码在RNA上(新冠病毒就是一个典型例子),或是癌细胞在大量增殖时用到的信使RNA,找到其中与健康细胞mRNA不同的序列,理论上都可以作为靶点,将其破坏。

“理论上听起来很诱人,早在差不多二十年前就有人提出了用DNAzymes进行治疗,可惜的是,在医疗实践中却迟迟起不了作用。”德国杜塞尔多夫大学(HHU)生物物理研究所的研究员Manuel Etzkorn博士说,“体外实验中,DNAzymes可以在试管里非常有效地破坏RNA分子;但在细胞里,很少看到这样的事发生,肯定有一个拮抗的过程在阻止DNAzymes。”

为了改进和开发DNAzymes,使之在细胞中发挥出治疗潜力,科学家们决定从根本入手,对DNAzymes的动态作用方式一探究竟。近日,Etzkorn博士带领的团队与其合作者在***学术期刊《自然》发表论文,报告了他们的发现。

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在这项研究中,利用高分辨率实时核磁共振(NMR)、电子顺磁共振和荧光光谱,以及分子动力学模拟等技术方法,科学家们得以在原子水平提出了DNAzymes的结构和催化机制,包括整个系统如何动态运行,结合和切割RNA的步骤,以及哪些辅助因子支持反应。用研究人员在论文中的话说,涉及到了“一个出人意料又令人兴奋的分子结构,明显的构象可塑性,和金属离子的动态调节作用”。

具体来看,DNAzymes的催化核心以***的方式裹住RNA链,通过先前未知的限速瞬态中间状态将其切成两段。而在切割位点,研究人员还找到了有关RNA碱基偏好的信息。

研究结果确定金属镁是一种关键的辅助因子,这还可以解释为什么DNAzymes在细胞中不能很好地发挥作用。“镁与DNAzymes的结合相对较弱,只是短暂地与之结合。细胞中还有其他成分对镁有着更大的亲和力,可以说,它们会从DNAzymes中把镁‘偷走’。”论文***作者Jan Borggräfe博士说。

下一步研究人员打算在细胞培养物和类器官中进行研究,通过提高DNAzymes与镁离子结合的能力,增加它们在生物组织中的活性。

随着这项新研究在结构学上带来的洞见,科学家们计划着手设计下一代DNAzymes,显著提高其性能,***终在治疗和生物技术领域真正发挥活性DNA分子的潜力。

Etzkorn博士还强调了DNAzymes在另一个重要领域的应用潜力:神经退行性疾病。他介绍说:“拿帕金森病来说,α-突触蛋白可以促进神经毒性,而以产生α-突触蛋白的信使RNA序列为靶点,某些情况下我们或许可以用DNAzymes来破坏这些RNA。”

我们拭目以待这种具有治疗潜力的活性DNA分子。

核酸提取磁珠作为新冠病毒RNA提取的重要原料,是吉恩特生物自主研发生产的高分子材料,将均一的分子材料的粒径控制在合理的范围内,加入磁性,再引入配基,从而使分子材料具备磁响应性和生物吸附性能,在核酸提取的过程中可以得到良好的应用,尤其是GNT-108磁珠,更是对新冠病毒的RNA提取具有较高的特异性,提取结果可直接应用与下游定量检测。

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