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三个关键环节控制血液ctDNA-EGFR的标准化流程

作者: 发布时间:2018-02-15 浏览次数:2131
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近些年,以血液等为样本基础的液体活检技术飞速发展。多项研究表明,大部分晚期NSCLC患者的血液中存在循环游离DNA(cfDNA)及循环肿瘤DNA(ctDNA);并且已有研究显示外周血ctDNA EGFR基因突变检测结果对EGFR-TKIs疗效有预测作用。因此,当肿瘤组织难以获取时,无创、易采集的血液检测就是组织EGFR基因突变分析合适的替代选择,并且血液检测在一定程度上能有效克服肿瘤异质性,可实现无创实时动态检测等。

标准化的检测流程是保障ctDNA-EGFR血液检测质量的前提,临床专家对于血液检测应用规范问题也多有探讨,并于2015年12月8号在《中华医学杂志》上发表了由吴一龙、王洁等教授整理的《非小细胞肺癌血液EGFR基因检测中国专家共识》。其中,标本采集及处理、cfDNA的提取、EGFR突变检测是血液检测的三个重要环节。

一、血液EGFR基因突变检测之标本采集及处理

1、患者选择:研究显示,肿瘤分期越高,ctDNA检出率越高,即III或IV期的肿瘤患者血液中的ctDNA相较Ⅰ/Ⅱ期的患者含量更高,更容易被检出。因此,为提高血液EGFR检出率,建议选择晚期患者。

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须知药物治疗过程中,EGFR突变情况以及ctDNA的浓度可能发生变化。如下图所示:

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2、标本采集及分离:全血中血浆和血清均能分离出ctDNA,但研究显示,相对于血清标本,血浆中ctDNA有更高的检出率。另外,对同一患者,血浆量越多所提取的DNA量就越多,其中含有的cfDNA量就越多,对检测越有利,如下图所示:

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因此按照专家共识建议采集10ml全血(可分离4-5ml血浆),采集完成后需温柔颠倒混匀,以便于抗凝剂或保护剂充分与血液接触。

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此时需根据使用的采血管类型(常规EDTA抗凝管/专用常温采血管)进行不同的后续操作。

(1):用常规EDTA抗凝管采集全血后,为防止游离DNA的降解,避免野生型DNA背景的增加,建议两小时内以足够的离心力将全血充分低温离心两次[11],分离出不含细胞成分的血浆,吸取操作如下图所示,分离出的血浆放置于-70℃冻存直至DNA抽提,或直接进入DNA抽提步骤(备注:离心前临时保存应暂放于2~8℃冷藏);

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(2):用含有游离DNA保护剂及防细胞裂解保护剂的专用常温采血管采集后轻摇混匀,常温放置不超过5-7天,以足够的离心力将全血充分离心两次,分离出不含细胞成分的血浆,放置于-70℃冻存直至DNA抽提,或直接进入DNA抽提步骤。如果外送运输全血,建议使用cfDNA专用常温采血管。

禁用肝素抗凝管:由于肝素使得DNA抽提得率降低并在DNA提取过程中难以去除,肝素也会导致PCR效率降低,因此cfDNA检测血液采集禁用肝素抗凝管。

3、血浆质量评价

(1)血浆是否溶血:如发生严重溶血,标本不可用,血红蛋白及其代谢产物可能抑制Taq酶活性,使PCR扩增效率明显降低。

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(2)血脂是否过高:血脂过高,使血浆呈乳白色,低密度脂蛋白对荧光有屏蔽和吸收作用,故对PCR有干扰。

二、血液EGFR基因突变检测之cfDNA提取

10ml全血分离出的4-5ml血浆用于cfDNA的提取,目前可用于cfDNA提取的方法很多,有实验室自建方法,也有商用核酸提取试剂盒。建议采用国家药监部门批准的、大容量血浆游离DNA分离试剂盒。

所提取的cfDNA建议马上使用,若不能立即进行后续检测而需要储存cfDNA,***-80℃冰箱冻存。若无-80℃冰箱,可选择-20℃保存,应尽可能缩短冻存时间,尽快进行后续检测。冻存时注意密封及标记完整,避免反复冻融。

三、血液EGFR基因突变检测

中国国家食品药品监督管理总局(CFDA)在2015年2月批准吉非替尼说明书更新,可通过血液ctDNA检测EGFR基因突变指导吉非替尼治疗。近期,CFDA更是通过创新医疗器械特别审批的方式,快速批准艾德生物(股票代码:300685)自主创新产品Super-ARMS® EGFR检测试剂盒(Super-ARMS技术是在原有ADx-ARMS技术优势基础上,优化引物探针设计和反应体系,将检测灵敏度提升至0.2%,完全适用于对灵敏度要求更高的血液检测领域)用于血液ctDNA-EGFR基因突变的检测。由此可见,ctDNA-EGFR标准化检测的时代已经到来!

为了降低假阳性概率,推荐使用经国家药监部门批准的高敏感度的检测方法用于ctDNA样本的EGFR基因突变检测。专家共识中也指出,检测必须在具有资质的检测中心进行。检测方法必须进行严格的验证及质控。检测试剂须使用经CFDA批准的检测试剂盒。目前,检测基因突变***常用的方法是扩增阻遏突变系统(ARMS法),欧盟批准用于指导吉非替尼治疗的血液检测方法也是ARMS检测方法。而Super-ARMS®方法是CFDA批准用于血浆中EGFR突变检测的敏感度***高的ARMS方法,其检测灵敏度可达0.2%。

根据今年ESMO(欧洲临床肿瘤协会年会)大会上,上海肺科医院周彩存教授、广东省人民医院吴一龙教授等多位肺癌权威专家共同发布的AURA 17扩展研究数据可知[12],Super-ARMS® 技术检测血浆T790M突变的阳性检出率仅次于目前灵敏度***高的ddPCR技术,更重要的是,Super-ARMS®技术检出的血液T790M突变阳性患者服务奥希替尼的客观响应率(ORR)***高,高达64%,说明灵敏度0.2%的Super-ARMS®技术是临床血液ctDNA检测的***优选择,疗效预测的准确性***高,是血液检测临床应用的可靠技术。

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总之,血液EGFR突变检测的标准化、合规化是保证检测准确率的核心,在减少操作流程对检测结果影响的前提下,选择经国家药监部门严格审批上市的检测产品和合规***的检测机构也是至关重要的。

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