Cap2 是在近 50 年前被发现的，是与 m 一起装饰 mRNA 的五种主要甲基修饰之一。7G， N6，2′-O-二甲基腺苷（m6一个m）、Cap1 和 N6-甲基腺苷（m6尽管转录组中Cap2的患病率很高，但Cap2是***后一个主要的未定位核苷酸修饰。使用CLAM-Cap-seq，研究人员生成了Cap2的转录组范围图谱，该图谱揭示了长寿命mRNA上的强Cap2富集，这是由于转录组中mRNA年龄引导的Cap2沉积而发生的。Cap2的主要功能不是控制mRNA加工事件，如翻译或稳定性，而是进一步抑制内源性RNA激活先天免疫反应的能力。从机制上讲，Cap2中的双重甲基化阻止Cap1与RIG-I结合，从而抑制内源性Cap1 RNA的自身免疫潜力。研究人员还表明，mRNA中Cap2的缓慢，时间依赖性积累代表了一种细胞适应，用于掩盖宿主RNA激活RIG-I。同时，缓慢的Cap2甲基化降低了快速复制的病毒RNA获得Cap2的可能性，从而逃避宿主细胞防御的识别。       

图1：Cap2 是一种在不同序列环境中发现的可变 mRNA 修饰。

细胞需要区分自身和非自身RNA的机制。mRNA帽的甲基化是标记自身mRNA的主要机制之一。缺乏核糖甲基化的Cap0 RNA是RIG-I的高亲和力配体和有效激活剂。因此，少量的Cap0可以激活先天免疫反应。Cap1中单个甲基的存在足以降低RNA激活RIG-I的能力。尽管Cap0与RIG-I的结合亲和力为2 nM，但Cap1仍以425 nM的亲和力结合。研究人员发现，通过消耗CMTR1或病毒感染获得的大量Cap2 RNA可以提供足够水平的Cap1来激活RIG-I。因此，即使Cap1仅微弱地激活RIG-I，细胞中大量的Cap1，加上响应病毒感染诱导RIG-I表达，可以使Cap1 RNA成为RIG-I信号传导的重要激动剂。

图2：CLAM-Cap-seq 鉴定特定 mRNA 上的 Cap2 甲基化富集。

先前的研究表明，RNA***或第二位置的甲基化足以减少RIG-I的活化。研究人员发现Cap2中的双重甲基化功能降低了Cap1 RNA结合和激活RIG-I的能力。尽管研究人员的研究将RIG-I确定为Cap2的“反读取器”，但RIG-I KO并没有完全减少CMTR2耗尽后ISG的诱导。其他蛋白质，如IFITs或其他外来RNA传感器，如MDA5，也可能对 Cap2 甲基化敏感，因此调节 mRNA 生物学的各个方面。

值得注意的是，一些病毒已经获得了CMTR2同系物，例如Mimivirus和非洲猪瘟病毒。牛痘病毒中的CMTR同系物已被提出用于甲基化***，第二和可能的其他核苷酸。因此，病毒CMTR同系物可能具有比以前认识到的更广泛的甲基化功能，包括Cap2甲基化，这可能有助于它们逃避宿主反应。

图3：Cap2甲基化在长寿命mRNA上高度富集。

Cap1和Cap2的水平在不同的细胞和组织中有所不同，这与CMTR2水平部分相关。虽然较高的Cap1水平可能对细胞有害，但研究人员发现这些细胞通常表现出较低的RIG-I表达，这可能会降低高水平的Cap1 RNA的自身炎症潜力。细胞可以调整CMTR2的水平以影响其对宿主或病毒RNA的细胞反应，并且Cap1的异常水平可能导致与先天免疫反应过度激活有关的疾病。

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