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Cancer Cell上就有一个零基础教程,手把手带你研究某种肿瘤的转移机制。而临床医生***不缺的就是组织样本,而用各种组织芯片进行DNA、RNA、蛋白质水平的筛选也早已经是家常便饭的事情。如此就可以筛选出自己想要的与肿瘤转移相关的基因或靶向分子。
既然“嫌疑分子”已经确定了,随后就要针对其与该肿瘤是否“狼狈为奸”进行调查,为其成为肿瘤转移的罪魁祸首拿下真正的铁证。此时,可以兵分两路:一方面对该分子与该肿瘤病理表征进行分析,另一方面也可以用裸鼠、肿瘤细胞系对此进行验证。
这时,肿瘤转移似乎已经露出了冰山一角,接下来自然少不了对背后的机制进行深入的挖掘。毕竟,靶分子在肿瘤细胞并不是以“独行侠”的身份来行走江湖的,它需要通过与蛋白质彼此间的“依附”或“抗争”来完成肿瘤转移的使命。那么在将与靶分子息息相关的蛋白分子揪出后,就需要细细查看该蛋白是否参与了某种信号通路,而后地毯式调查其对该通路中上下游分子的影响。
此时就是大家拼人品的时刻了!如果你人品大爆发,你所找寻的蛋白质竟是某一明星通路的“核心大腕”又或者有幸碰到通路中一些“明星分子”,则该蛋白的一举一动都会牵扯该信号家族的整体命运,那么只要能将该分子与明星通路之间的“爱恨纠葛”阐明清楚,又何愁发表不了高分文章呢?
接下来看一篇肿瘤转移研究经典套路应用,这是Cancer Cell杂志上的一篇文章《GOLM1 Modulates EGFR/RTK Cell-Surface Recycling to Drive Hepatocellular Carcinoma Metastasis》。
已有的研究发现生长因子反馈受体激酶(RTKs)在肿瘤转移过程中起着重要的调控作用,RTKs的内吞和回收机制,可增强了生长因子对癌细胞有丝***的控制。而RTKs的回收和降解过程又是受到高尔基体(Golgi)的控制。复旦大学钦伦秀课题组则发现了一个Golgi相关的蛋白分子编码基因GOLM1可调控HCC肿瘤细胞转移,而本研究则详细解读了GOLM1在肝癌转移中的作用角色及具体机制。
***后看看作者具体做了些什么?是不是临床医生能方便的“复制”出他的实验过程呢?
1.HCC转移特异性基因筛选
研究人员利用高通量表达谱芯片,对肝外转移组织(EHMH),自由转移肝组织(MFH)和正常肝组织进行了全基因组表达模式差异分析。结果筛选出了一个与编码高尔基体相关蛋白GOLPH2的基因——GOLM1,并将其作为HCC转移调控的候选研究基因。
2. GOLM1与HCC病理表征分析
研究人员运用组织芯片对375个病人进行了GOLM1表达分析,发现高表达组肿瘤微管侵袭增高,总生存率(OS)低,复发(TTR)时间早。Cox比例风险回归分析显示,高表达的GOLM1可作为OS和TTR的独立诊断指标。因此,GOLM1的过量表达与HCC的不良预后密切相关。
3.GOLM1调控功能分析
不同HCC细胞系中,GOLM1高表达的细胞系伴随着高的侵袭和转移能力,GOLM1低表达细胞系中进行补救实验后则可以恢复肿瘤细胞的侵袭转移能力。另外,在小鼠模型中的gain-和loss-of-function实验表明GOLM1对促进HCC生长和转移非常重要。
4.GOLM1作用机制分析
GOLM1通过选择性地与表皮生长因子受体EGFR结合,介导EGFR/RTK 锚定到trans-Gogi network上,促进其回收到质膜上而激活下游激酶,进而促进HCC的生长和转移。