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在人类细胞中,成百上千个线粒体DNA(mtDNA)以拟核(nucleoids)的形式均匀分布在线粒体网络中。线粒体拟核在细胞中的均匀分布对维持线粒体DNA的稳定以及线粒体正常行使功能至关重要。
目前的观点认为,线粒体拟核在细胞中的运动是受限的,其在线粒体中的均匀分布依赖于线粒体的融合和***过程【3-6】。然而,细胞内是否存在拟核的主动运输过程,以及这种主动运输过程是如何帮助线粒体拟核实现均匀分布目前尚无定论。
北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)孙育杰课题组与中国科学院生物物理所李栋课题组合作,在Nature Communications杂志上发表文章ER-mitochondria contacts promote mtDNA nucleoids active transportation via mitochondrial dynamic tubulation,报道了线粒体拟核的一种新型分配机制。
研究人员借助GI-SIM超分辨成像技术,对细胞内的线粒体以及线粒体拟核的动态过程进行多色、高速、长时程的超分辨成像。线粒体动态管化是指马达蛋白KIF5B在线粒体本体上沿着微管拖出一条动态细管。
研究人员发现线粒体拟核可以随着线粒体动态管化过程进入拖出的细管并***终定位在管子***。研究者发现线粒体拟核随着动态管化运动的过程并非仅仅是一种搭车行为,线粒体拟核会以超过管子延伸的速度在细管中做主动运动(图1)。
图1. 线粒体动态管化过程介导拟核的运输
此外,研究人员还发现动态管化过程经常起始于内质网与线粒体的互作位置,这也是mtDNA广泛存在与合成的位置(图2)。当对内质网、线粒体和线粒体拟核同时成像,研究人员发现起始于内质网与线粒体互作位置的动态管化过程可以介导线粒体拟核的主动运输。
图2. 线粒体动态管化起始于内质网与线粒体互作区域
接下来,研究人员对上述线粒体拟核的主动运输过程的分子机制进行了探究。研究人员用超分辨成像以及免疫共沉淀的方法,证明了线粒体内膜上的Mic60蛋白可以分别和线粒体基质中的拟核以及线粒体的外膜蛋白Miro1相互作用。Miro1同时也是KIF5B在线粒体上的受体蛋白,并且富集在内质网与线粒体的互作位置。
此外,敲低Mic60会导致Miro1蛋白量的降低、拟核的聚集、内质网与线粒体互作位置的稳定性降低。这些证据表明,位于内质网与线粒体互作位置的线粒体拟核可以通过Mic60-Miro1蛋白间接地与KIF5B蛋白相互作用,从而随着KIF5B介导的动态管化过程进行主动运动(图3)。
***后,研究者发现,由线粒体动态管化介导的拟核运输对拟核在线粒体外围网络中的分布非常重要。研究者通过敲低Mic60蛋白来阻断线粒体拟核与KIF5B的连接,发现线粒体拟核集中分布在细胞核周围的线粒体中,而细胞外围线粒体网络中很少有线粒体拟核。
图3. 线粒体动态管化介导拟核运输的分子机制模型
综合以上结果,文章提出线粒体拟核可以通过起始于内质网与线粒体互作位置的动态管化进行运输,并对其分子机制进行了探究。该模型对解释线粒体拟核在线粒体网络的分布提供了新的视角,对研究线粒体拟核在相关疾病以及衰老中的功能具有重要意义。