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在DNA层面上,人类与我们的近亲黑猩猩和倭黑猩猩鲜有差别。在DNA片段中,人类和黑猩猩的序列有90%以上是一样的。而且,在大多数情况下,几乎没有什么基因是人类或者黑猩猩特有的。
也就是说,了解人类进化的大部分***,应该放在那些微小的变化上,它们改变了基因活动的时间或水平,从而产生了更为深远的影响。
但这并不是说新进化的基因与人类进化无关。近日,一项由中国科学家团队进行的新研究,揭示了自人类与类人猿近亲在进化上分道扬镳以来,一类新基因是如何进化的。
在对这类基因的进化过程有了一定了解之后,研究人员又进一步探索了其中一种新进化而来的基因,结果发现,它在构建更大的脑的方面发挥了关键作用。论文已发表在《自然·生态学与进化》上。
从RNA到蛋白质
我们通常谈到的很多基因,都是负责编码蛋白质的。简单来说,基因,也就是DNA中的信息被转录成信使RNA(mRNA),接着再被翻译成蛋白质。但反过来说,如果蛋白质没有被制造出来,那么这个基因似乎就没了“作用”。然而,随着近几十年的研究,我们已经知道,这不是基因***的“选择”。实际上,一些被转录成RNA的基因并没有翻译成蛋白质。相反,RNA本身执行着一种关键功能。
自从20世纪50年代发现***种功能性RNA以来,这类RNA的名单稳步增长,现在我们已经知道了许多非蛋白质编码的功能性RNA。这些RNA的作用包括改变蛋白质编码基因的活性,维护染色体的末端,以及剪接出未使用的mRNA的片段。
其中一类被称为长非编码RNA(lncRNA)。它们往往在开始时很像mRNA,但lncRNA不会被送去翻译成蛋白质,而是和DNA一起留在细胞核,在那里它们被用来控制其他基因的活动。
同时,换个角度来说,基因控制蛋白质生成的这些复杂步骤似乎暗示着,在进化的随机突变中,想要制造一种新的蛋白质编码基因其实并不简单,它在理论上来说需要很多步。
然而,对物种的新基因的研究表明,lncRNA和mRNA之间的差异有时会在进化的过程中被打破。一个物种中的一些蛋白质编码基因也会被发现在亲缘物种中不再编码任何东西,而是在那里作为lncRNA发挥作用。这表明,突变已经将一些lncRNA的基因转化成了蛋白质编码基因。新研究的***是确定这是不是人类进化的因素之一。
研究人员利用公共基因组数据库,比较了人类、黑猩猩和关系更远的猕猴的基因组。他们发现,自从人类和黑猩猩的祖先从猴中分道扬镳后,有29个案例中的lncRNA已经演变成了蛋白质编码基因。另有45个基因在人类从黑猩猩和倭黑猩猩的祖先中分道扬镳后经历了这个过程。
ctDNA的提取在肿瘤筛查中,是重要的前置步骤。目前常用的提取方法是利用生物磁珠,主要是硅羟基磁珠或羧基磁珠对血清血浆的ctDNA进行提取,由于磁珠的粒径小,比表面积大,在特定提取缓冲液中,对核酸的吸附会更加灵敏,相比于其他方法,使用生物磁珠对进行ctDNA提取得率会更高,检测灵敏度和检出限也会更合适,搭配核酸提取仪,更能实现全程自动化的提取。