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目前蛋白质表达谱的研究有两个技术难题,一是如何保证蛋白质来源的均一。因为体内组织器官各种细胞混杂在一起,如各类神经元细胞,突触很长,难于分离纯化。二是如何在体内动态观察某类或某些细胞的蛋白质的代谢。
今天荷叶给大家介绍一种体内细胞特异的蛋白质代谢谱标记方法,该方法对蛋白质表达谱的研究十分有用,希望对科研狗们有点用。
细胞蛋白质标记的基本原理:蛋白质的合成依赖于转运tRNA合成酶,不同的氨基酸有特定的转运tRNA合成酶。通过对特定转运tRNA合成酶进行突变使其改变转运氨基酸的种类,转运非经典的氨基酸。
外源补充非经典的氨基酸后,待细胞利用非经典氨基酸合成新蛋白后,通过“点击化学”(Click Chemistry)的方法将含有非经典的氨基酸的蛋白质进行标记,可以分离纯化新合成的蛋白质。
然后进行质谱分析(BONCAT,bio-orthogonal non-canonical amino-acid tagging,生物正交非经典氨基酸标记),也可以对非经典氨基酸进行荧光标记,在体观察蛋白质的合成(FUNCAT,fluorescent non-canonical amino-acid tagging)。
甲硫氨酸转运tRNA合成酶的突变,转运叠氮正亮氨酸ANL
叠氮与炔基的点击化学反应
如何实现细胞特异的蛋白质标记呢?可以利用Cre-loxp系统,利用细胞特异的启动子驱动突变的转运tRNA合成酶,在特异的细胞、特定的时间表达突变的转运tRNA合成酶。