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近日,来自哥伦比亚大学(Columbia University)的华人学者 Harris Wang 教授把CRISPR 这套系统改造成了“录音笔”,用来记录生物体内转瞬即逝的生理信号。该成果在***学术期刊《科学》上发表。
以 CRISPR-Cas9 为代表的基因编辑手段,让CRISPR 系统在当下***为火热的应用,也是基因疗法领域***富潜力的工具之一。CRISPR-Cas9 系统的巨大成功让人们在潜意识里将 CRISPR-Cas 等同于精准的基因“魔剪”,却忽略了它本身其实是细菌体内的“免疫系统”。在细菌里,CRISPR-Cas 系统能把外来病毒的 DNA 片段切断,并整合到自己的 CRISPR 位点中。一旦将来有同样的病毒入侵,细菌就能根据自己在 CRISPR 位点存下的“通缉令”,快速产生抗病毒反应。
Wang 教授的团队意识到,CRISPR-Cas 系统的这一特性使细菌的基因组能按时间顺序,记录下它们及其祖先曾接触过的病毒信息。该研究的***作者 Ravi Sheth 从中产生了灵感:“我们能记录转瞬即逝、不断变化的电信号或者是声音。这些技术非常强大。我们能不能想出一个办法,把类似的技术应用到活体细胞里呢?”
▲生理信息能被储存在细菌的 CRISPR 位点里(图片来源:哥伦比亚大学)
为了打造这样一款生理信息的“录音笔”,Wang 教授的团队合成了两种特殊的质粒。其中一种质粒能对外来的特定生理信号做出反应,并随之扩增;另一种质粒则能表达 CRISPR-Cas 系统的元件。按研究人员们的设想,在没有外来生理信号的情况下,后者会不断往细菌的 CRISPR 位点里插入“空白序列”。而当外来信号出现时,前者就会启动,在 CRISPR 位点里留下自己的印记。在一段时间过后,只要对这些细菌体内的 CRISPR 位点进行测序和分析,就能知道是否存在研究人员想要监控的生理信号。根据“印记”的产生位置,我们甚至还能反推出生理信号的出现时间!
实验验证了这一思路的可行性。在本项研究中,研究人员显示,在大肠杆菌里,这套系统能同时记录至少 3 种不同的生理信号,并能持续记录数日。
▲这套系统能连续追踪生理信号数日(图片来源:哥伦比亚大学)
“当患者们吞下这些细菌,或许就能记录下整个消化道中的变化。过去,这是一块难以企及的区域。现在,我们提供了一种***的方法。”Wang 教授说道。此外,研究人员们也表示,这一工具有望被用在环境科学、生态学、以及微生物学中,记录这些细菌所接收到的外在刺激。
该项目是***用 CRISPR 技术记录特定的细胞生理信号。未来计划寻找在健康和生病状态下的多种标志物,从而把该系统应用于医学领域。